Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec2Q9WV35 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms