Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zeb2Q9R0G7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms