Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms