Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rdh11Q9QYF1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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