Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms