Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms