Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms