Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hmgn5Q9JL35 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgn5Q9JL35 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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