Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms