Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl39Q9JKF7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl39Q9JKF7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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