Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms