Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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