Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp29Q9ES63 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms