Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms