Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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