Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms