Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Med27Q9DB40 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Med27Q9DB40 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Med27Q9DB40 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Med27Q9DB40 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Med27Q9DB40 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Med27Q9DB40 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Med27Q9DB40 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms