Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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