Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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