Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms