Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3404Q9D506 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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