Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms