Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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