Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms