Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18l2Q9D174 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms