Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1aQ9D132 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1aQ9D132 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1aQ9D132 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1aQ9D132 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms