Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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