Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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