Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SdhdQ9CXV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms