Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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