Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms