Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms