Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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