Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg12Q9CQY1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms