Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Nicn1Q9CQM0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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