Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms