Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd2aQ9CQJ1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms