Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms