Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms