Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms