Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms