Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl3Q99N95 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl3Q99N95 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms