Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp16Q99LG0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp16Q99LG0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms