Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DhddsQ99KU1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms