Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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