Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlcd1Q99JT6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms