Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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