Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms