Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VDP2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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