Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms